Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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