Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DXG7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DXG7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DXG7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DXG7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DXG7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DXG7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DXG7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DXG7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms