Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms