Protein–RNA interactions for Protein: A4QPH2

PI4KAP2, Putative phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP2A4QPH2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP2A4QPH2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms