Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms