Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB3A0JP26 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB3A0JP26 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms