Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPRNQ16849 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRNQ16849 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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