RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362804.1

RNU6-862P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 862, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-862P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-862P-201ENST00000362804 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-862P-201ENST00000362804 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-862P-201ENST00000362804 POTEDQ86YR6 584 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-862P-201ENST00000362804 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-862P-201ENST00000362804 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLPPR3Q6T4P5 718 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-862P-201ENST00000362804 FOXD1Q16676 465 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-862P-201ENST00000362804 ADRA2BP18089 450 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-862P-201ENST00000362804 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-862P-201ENST00000362804 MSH5O43196 834 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-862P-201ENST00000362804 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU6-862P-201ENST00000362804 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-862P-201ENST00000362804 KCNA4P22459 653 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-862P-201ENST00000362804 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-862P-201ENST00000362804 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-862P-201ENST00000362804 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-862P-201ENST00000362804 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-862P-201ENST00000362804 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-862P-201ENST00000362804 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-862P-201ENST00000362804 EHMT2Q96KQ7 1210 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-862P-201ENST00000362804 POTEHQ6S545 545 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-862P-201ENST00000362804 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-862P-201ENST00000362804 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-862P-201ENST00000362804 DNAJC5BQ9UF47 199 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-862P-201ENST00000362804 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-862P-201ENST00000362804 CSRNP3Q8WYN3 585 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-862P-201ENST00000362804 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-862P-201ENST00000362804 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZBTB22O15209 634 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-862P-201ENST00000362804 SLC4A2P04920 1241 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-862P-201ENST00000362804 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-862P-201ENST00000362804 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RNU6-862P-201ENST00000362804 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-862P-201ENST00000362804 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-862P-201ENST00000362804 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-862P-201ENST00000362804 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RNU6-862P-201ENST00000362804 RNF39Q9H2S5 420 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-862P-201ENST00000362804 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-862P-201ENST00000362804 APLP2Q06481 763 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-862P-201ENST00000362804 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-862P-201ENST00000362804 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-862P-201ENST00000362804 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-862P-201ENST00000362804 FKBP8Q14318 412 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-862P-201ENST00000362804 CAPN15O75808 1086 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-862P-201ENST00000362804 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-862P-201ENST00000362804 FBLN2P98095 1184 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-862P-201ENST00000362804 POLA2Q14181 598 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-862P-201ENST00000362804 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPDYE4A6NLX3 237 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-862P-201ENST00000362804 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-862P-201ENST00000362804 FBXO3Q9UK99 471 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-862P-201ENST00000362804 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-862P-201ENST00000362804 ABCB7O75027 752 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-862P-201ENST00000362804 DSG3P32926 999 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-862P-201ENST00000362804 PROM2Q8N271 834 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-862P-201ENST00000362804 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPDYE2BA6NHP3 402 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPDYE6P0CI01 402 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPDYE2Q495Y8 402 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-862P-201ENST00000362804 VASPP50552 380 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-862P-201ENST00000362804 STAG3Q9UJ98 1225 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-862P-201ENST00000362804 OSCARQ8IYS5 282 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-862P-201ENST00000362804 SSUH2Q9Y2M2 353 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-862P-201ENST00000362804 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLEKHG5O94827 1062 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-862P-201ENST00000362804 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-862P-201ENST00000362804 KLHL34Q8N239 644 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-862P-201ENST00000362804 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-862P-201ENST00000362804 SLC24A1O60721 1099 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLCD3Q8N3E9 789 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-862P-201ENST00000362804 MIER1Q8N108 512 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPOCK2Q92563 424 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-862P-201ENST00000362804 CHRDL2Q6WN34 429 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-862P-201ENST00000362804 AKT1S1Q96B36 256 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-862P-201ENST00000362804 LHX8Q68G74 356 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 DCAF8L2P0C7V8 631 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 PKD2Q13563 968 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 TRIM41Q8WV44 630 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 PRR29P0C7W0 189 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 CLEC11AQ9Y240 323 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 GSE1Q14687 1217 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLCB2Q00722 1185 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 TAOK2Q9UL54 1235 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 DCAF8Q5TAQ9 597 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 FAM212AQ96EL1 285 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 CREBZFQ9NS37 354 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-862P-201ENST00000362804 HAX1O00165 279 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms