Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD4Q13485 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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