RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.88□□□□□ -0.19
RNU6-772P-201ENST00000516042 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RNU6-772P-201ENST00000516042 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RNU6-772P-201ENST00000516042 FOXD1Q16676 465 aa11.88□□□□□ -0.51
RNU6-772P-201ENST00000516042 POTEDQ86YR6 584 aa11.77□□□□□ -0.53
RNU6-772P-201ENST00000516042 MSH5O43196 834 aa11.34□□□□□ -0.59
RNU6-772P-201ENST00000516042 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
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RNU6-772P-201ENST00000516042 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.74□□□□□ -0.69
RNU6-772P-201ENST00000516042 ADRA2BP18089 450 aa10.7□□□□□ -0.7
RNU6-772P-201ENST00000516042 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU6-772P-201ENST00000516042 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RNU6-772P-201ENST00000516042 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-772P-201ENST00000516042 RNF39Q9H2S5 420 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-772P-201ENST00000516042 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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RNU6-772P-201ENST00000516042 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.33□□□□□ -0.92
RNU6-772P-201ENST00000516042 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RNU6-772P-201ENST00000516042 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.27□□□□□ -0.93
RNU6-772P-201ENST00000516042 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.25□□□□□ -0.93
RNU6-772P-201ENST00000516042 POTEHQ6S545 545 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU6-772P-201ENST00000516042 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
RNU6-772P-201ENST00000516042 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RNU6-772P-201ENST00000516042 DSG3P32926 999 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-772P-201ENST00000516042 CAPN15O75808 1086 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-772P-201ENST00000516042 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RNU6-772P-201ENST00000516042 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RNU6-772P-201ENST00000516042 ABCB7O75027 752 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 APLP2Q06481 763 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-772P-201ENST00000516042 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-772P-201ENST00000516042 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC4A2P04920 1241 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-772P-201ENST00000516042 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RNU6-772P-201ENST00000516042 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RNU6-772P-201ENST00000516042 POLA2Q14181 598 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-772P-201ENST00000516042 AKT1S1Q96B36 256 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNA4P22459 653 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-772P-201ENST00000516042 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-772P-201ENST00000516042 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RNU6-772P-201ENST00000516042 HAX1O00165 279 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-772P-201ENST00000516042 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU6-772P-201ENST00000516042 PITPNM1O00562 1244 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-772P-201ENST00000516042 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
RNU6-772P-201ENST00000516042 OSCARQ8IYS5 282 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-772P-201ENST00000516042 EVX2Q03828 476 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RNU6-772P-201ENST00000516042 LHX8Q68G74 356 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-772P-201ENST00000516042 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-772P-201ENST00000516042 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-772P-201ENST00000516042 GABBR2O75899 941 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPDYE6P0CI01 402 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-772P-201ENST00000516042 FBLN2P98095 1184 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHADLQ6NUI6 762 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-772P-201ENST00000516042 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-772P-201ENST00000516042 POTEIP0CG38 1075 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRR29P0C7W0 189 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLCN6P51797 869 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-772P-201ENST00000516042 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-772P-201ENST00000516042 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZBTB22O15209 634 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-772P-201ENST00000516042 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-772P-201ENST00000516042 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-772P-201ENST00000516042 POTEMA6NI47 508 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-772P-201ENST00000516042 OTUD5Q96G74 571 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-772P-201ENST00000516042 POTEGQ6S5H5 508 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-772P-201ENST00000516042 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-772P-201ENST00000516042 POTEB2H3BUK9 544 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-772P-201ENST00000516042 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-772P-201ENST00000516042 CREBZFQ9NS37 354 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-772P-201ENST00000516042 PHF12Q96QT6 1004 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-772P-201ENST00000516042 METRNQ9UJH8 293 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-772P-201ENST00000516042 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-772P-201ENST00000516042 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-772P-201ENST00000516042 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC39A7Q92504 469 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-772P-201ENST00000516042 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-772P-201ENST00000516042 C7P10643 843 aa7.15□□□□□ -1.26
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