Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CACNB1Q02641 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNB1Q02641 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms