Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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