Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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