RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CHIC1Q5VXU3 224 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLPPR3Q6T4P5 718 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNA4P22459 653 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADRA2BP18089 450 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FOXD1Q16676 465 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC24A1O60721 1099 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB22O15209 634 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FKBP8Q14318 412 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-1328P-201ENST00000410938 POTEDQ86YR6 584 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DNAJC5BQ9UF47 199 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MSH5O43196 834 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DCAF8L2P0C7V8 631 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BCANQ96GW7 911 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FBXO3Q9UK99 471 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC4A2P04920 1241 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLCB2Q00722 1185 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.2□□□□□ -1.58
RNU6-1328P-201ENST00000410938 APLP2Q06481 763 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CFAP44Q96MT7 982 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FBLN2P98095 1184 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KLHL34Q8N239 644 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NBR1Q14596 966 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SPOCK2Q92563 424 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1328P-201ENST00000410938 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PKD2Q13563 968 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLEKHG5O94827 1062 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLCD3Q8N3E9 789 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CHGAP10645 457 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PROM2Q8N271 834 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARXQ96QS3 562 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRHP20396 242 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STAG3Q9UJ98 1225 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MIER1Q8N108 512 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 POLA2Q14181 598 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RGL2O15211 777 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CAPN15O75808 1086 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C14orf37Q86TY3 774 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HOMEZQ8IX15 550 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM41Q8WV44 630 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GSE1Q14687 1217 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1328P-201ENST00000410938 P3H3Q8IVL6 736 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WDR70Q9NW82 654 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms