Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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