Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf131-202ENST00000354479 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms