Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A4Q9Y6R1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms