Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms