Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms