Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms