Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX4Q9Y2E6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms