Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms