Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms