Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK1Q9UPV9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms