Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLEC4EQ9ULY5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms