Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80Q9ULG1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms