Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms