Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXL4Q9UKA2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms