Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms