Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms