Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms