Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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