Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms