Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTLNQ9NXG0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTLNQ9NXG0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms