Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms