Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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