Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms