Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms