Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms