Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FZD3Q9NPG1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms