Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7BQ9NP56 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7BQ9NP56 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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