Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms