Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms