Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGR6Q9HBX8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR6Q9HBX8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms