Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms