Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP44Q9C0F1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms