Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms