Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms