Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms