Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms